Наука и технологии России

Вход Регистрация

Будет ли доступна вся геномная информация о человечестве онлайн? Интернет ДНК — это всего лишь концепция, или кто-то уже воплощает ее в жизнь?

13 декабря R&D центр Dell EMC совместно с ФРИИ организуют мероприятие в формате Science café на тему Интернет ДНК (Internet of DNA). 

Место проведения: ФРИИ Сити Холл. 

Регистрация: goo.gl/m8lBKr

Темп технологического развития действительно поражает: к 2031 году секвенирование генома будет занимать всего 94 секунды и стоить меньше 1 доллара. Такие масштабные перемены обещают значительно изменить наше общество.

В 2015 году MIT Technology Review назвало Интернет ДНК одной из самых прорывных технологий - www.technologyreview.com/s/535016/internet-of-dna/

Темы мероприятия:
- Интернет ДНК — концепция, суть, этапы реализации, драйверы и сдерживающие факторы
- Интернет ДНК и безопасность геномных данных, этические вопросы
- Каких результатов удалось достигнуть на сегодняшний день
- Как Россия может участвовать в процессе

Спикеры:
David Haussler, PhD in computer science, эксперт по биоинформатике Калифорнийского университета в Санта-Круз (University of California, Santa Cruz), один из основателей Международного Альянса по Геномике и Здравоохранению - Global Alliance for Genomics and Health.
Дэвид расскажет об общей задаче Интернета ДНК и статусе развития на сегодня.

Андрей Запарий, ведущий разработчик в области биоинформатики R&D Центра Dell EMC Россия в Сколково.
Андрей расскажет об особенностях создания технологической инфраструктуры для работы с геномными данными и их интеграции с традиционной медицинской информацией на примере пилотного проекта c Массачусетской больницей в Бостоне (Massachusetts General Hospital)

Программа:
18:30 – Начало регистрации
19:00 – 19:10 – Вступительное слово организаторов
19:10 – 19:40 – David Haussler, выступление в формате видео-конференции
19:40 – 20:00 – Андрей Запарий, Dell EMC 
20:00 – 20:45 – Панельная дискуссия с представителями российского академического сообщества и российских биотех-компаний
20:45 – Q&A

Приглашенные эксперты в рамках панельной дискуссии обсудят значимость создания Интернета ДНК, существующие или потенциальные проблемы в практике работы с потоками геномных данных, этические аспекты и вопросы безопасности, а также потенциальную роль России в этом процессе. 

Участники: 
- Валерий Ильинский, генеральный директор и сооснователь компании Genotek
- Сергей Мусиенко, генеральный директор биомедицинского холдинга "Атлас"
- Андрей Гаража, специалист по прикладным биомедицинским технологиям, директор центра биогеронтологии и регенеративной медицины
- Геннадий Рабаев, врач-онколог, генеральный директор «ОнкоГенотест»
- Михаил Пятницкий, биоинформатик, «Персональная биомедицина»

Модератор: Юрий Пеков, директор «Бластим». 

 Что такое Интернет ДНК?

Наверняка, вы много слышали про понятие персонализированной медицины. Она основана на обработке и анализе больших массивов новых типов данных, называемых «омиксными». Они получаются путем анализа структуры молекул ДНК, молекул РНК, белковых молекул и других типов подобных данных. Кроме того, учитываются и традиционные данные: результаты различных анализов, двухмерные и трехмерные изображения, записи и назначения в медицинской карте. Все они могут дать наиболее полную индивидуальную картину состояния организма пациента.

Однако для врача и исследователя имеют ценность не сами гигантские массивы геномной информации, а результаты их сложной математической обработки, а также сопоставления с аналогичными данными других больных в мире. Так, опыт миллионов других пациентов помогает в лечении и прогнозировании заболеваний конкретного больного. В первую очередь это касается онкологических, редких и инфекционных болезней.

А как это возможно сделать? Сейчас данные хранятся в медицинских и научных организациях по всему миру, все они имеют разные форматы и структуру. Они очень велики по объему и являются одним из главных и наиболее быстро растущих источников данных в мире. Например, Международный консорциум по изучению ракового генома описал 89 видов заболеваний. Для загрузки этих данных в полном объеме с самой быстрой скоростью потребуется примерно полгода.

Таким образом, объединив в Интернете ДНК информацию о геномах людей со всего мира и создав инфраструктуру для ее хранения, анализа и обмена, врачи и ученые могут диагностировать редкие заболевания и найти ключи к лечению многих болезней.

Развитием Internet of DNA занимается Международный Альянс по Геномике и Здравоохранению (Global Alliance for Genomics and Health). Альянс был основан в 2013 и объединяет университеты, медицинские организации научные центры и крупнейшие компании в области информационных технологий по всему миру. В Альянсе есть рабочие группы и проекты, которые в рамках общей цели создания Интернет ДНК работают над различными задачами. Исследователи надеются, что их работа может быть такой же важной для медицинской науки, как HTTP-протокол для Интернета в целом.

Помимо технологических задач Альянсом решаются социальные проблемы: согласие на обработку данных и передачи их между странами, аспекты конфиденциальности.
Среди членов Альянса представители 446 компаний и организаций из 70 стран мира. Туда входят в том числе представители Amazon Web Services, Google, University of Oxford, Berkeley, Harvard Medical School, National Cancer Center, Dell EMC и др.

Центр исследований и разработок Dell ЕМС по облачным технологиям и большим данным в Сколково специализируется на создании решений для облачных вычислений и технологий аналитики больших данных для решения задач в медицине, биологии, других отраслях. Центр сотрудничает с российскими университетами, государственными учреждениями, российскими и международными компаниями в сообществе «Сколково». В числе партнёров московского Центра компания Parseq Lab, Санкт-Петербургский Академический университет – научно-образовательный центр нанотехнологий Российской академии наук (СПб АУ НОЦНТ РАН, Академический университет), Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики» (НИУ ВШЭ). R&D Центр также является участником Глобального альянса по геномике и здравоохранению (GA4GH).

РЕЙТИНГ

4.00
голосов: 1

Обсуждение